Кафедра генетики

Кафедра генетики Южного Федерального Университета

Адрес: Стачки 194/1 к. 319

Телефон-факс: 219-87-94

Электронный адрес:

- зав. Кафедры: tshkurat@sfedu.ru

Заведущая кафедры - Татьяна Павловная Шкурат, профессор, доктор биологических наук, директор НИИ Биологии.


Кафедра генетики и цитологии была основана в 1962 г. профессором И.Ф. Лященко. В 1982 г. в связи с реорганизацией кафедра была ликвидирована и вновь воссоздана в сентябре 1992 г. С 1972 по 2006 гг кафедрой заведовал выдающийся ученый, профессор, доктор биологических наук, академик Российской экологической академии,член корреспондент Гуманитарной Академии, Действительный член Национального географического общества Америки, Соросовский профессор - Евгений Петрович Гуськов. С 2006 г по настоящее время заведующим кафедрой является Татьяна Павловна Шкурат, профессор, доктор биологических наук, директор НИИ Биологии. Активное участие в работе кафедры принимают сотрудники НИИ Биологии.

Евгений Петрович Гуськов.


Профессорско-преподавательский состав

  • Татьяна Павловна Шкурат  — зав. кафедрой, д.б.н., профессор.
  • Александр Вячеславович Усатов  — д.б.н., профессор.
  • Светлана Сергеевна Амелина - д.б.н., профессор
  • Нина Ивановна Беличенко — к.б.н, доцент.
  • Иван Иванович Бессчетнов  — к.б.н, доцент.
  • Татьяна Викторовна Вардуни— д.п.н., профессор.
  • Елена Владимировна Машкина  — д.б.н., профессор.
  • Анжела Аслановна Александрова  — к.б.н., доцент.
  • Мягкова Юлия Яковлевна — к.б.н., доцент.
  • Николай Викторович Маркин — к.б.н., ст.преподаватель.
  • Косенко Петр Олегович — к.б.н., ст.преподаватель.
  • Чугуева Ольга Ивановна — к.б.н., ст.преподаватель.
  • Елена Викторовна Бутенко — ассистент.
  • Екатерина Григорьевна Деревянчук - ассистент.

Учебная работа

В состав преподаваемых на кафедре учебных дисциплин входят следующие:

  • Биология клетки.
  • Гистология.
  • Биология индивидуального развития.
  • Генетика с основами селекции.
  • Теория эволюции.
  • Проблемы современного естествознания.
  • Философские проблемы естествознания.
  • Э/к Генетика человека, Современные проблемы генетики, экологическая генетика, биология старения, отечественное естествознание в мировой науке
  • С/к Цитогенетика, Гены и геномы, Мутагены окружающей среды, Генетика человека, Генная инженерия, Нехромосомная наследственность, Медицинская генетика, Молекулярная генетика, Генетика растений, История генетики, Современные проблемы мутагенеза, Геномика, Компьютерные методы анализа генетических данных, Молекулярно-генетические методы исследования, Спортивная генетика, Генетика старения.

  

   Базы практики: Медико-генетический научный центр РАМН (Москва), ГНЦ РФ Институт медико-                       биологических  проблем РАН (Москва), ГЦ «Биоинженерия» РАН (Москва), Институт физиологии растений         РАН (Москва), НИИ  Акушерства и Педиатрии (Ростов-на-Дону), АзНИРХ (Ростов-на-Дону), НИИ Биологии             ЮФУ.

 

  

 

 

Сотрудники и студенты кафедры принимают активное участие в работе всероссийских и международных конференций, посвященных современным проблемам     генетики.



 

        

 

                                               

 

 

 

 

 

 

Научная работа

Научно-исследовательская работа кафедры ведётся по направлениям:

  • 1. Некодирующая ДНК

    Цель исследований – разработка биоинформационной технологии поиска сценариев взаимодействия кодирующих белок и некодирующих белок участков ДНК, на основе теоретических расчетов большого объема данных с применением суперкомпьютеров, разработкой новых алгоритмов, программных приложений, построением математических моделей на основе особенностей организации геномов животных и человека.

     

     

    Рассмотрены задачи, связанные с выявлением закономерностей во взаимном расположении взаимосвязанных участков одного генома (сравнительное картирование локусов, поиск гомологичных участков), а также со сравнением геномов разных видов (вычисление медиан геномов и построение филогенетического дерева), с целью обнаружения связи между генетическими и фенотипическими признаками, изучения гибкости различных программ автоматического сравнения.

       

    Non-coding DNA

     The aim of the research is the bioinformatics technology development for the interaction scenarios search of the encoding protein and non-coding protein DNA regions, on the basis of theoretical calculations of a large data amount with use of supercomputers, of new algorithms development, of the software applications and of the mathematical models construction based on characteristics of the animals and humans genomes organization.

     

    The tasks associated with identifying regularities in the mutual arrangement of interrelated areas of one genome (comparative mapping of loci, the search for homologous sites) were considered as well as a comparison of the genomes of different species (calculation of median genomes and a phylogenetic tree construction), in order to detect connections between genetic and phenotypic characteristics and to study the different programs adaptability for the automatic comparison.

     

      

    Публикации (Publications):

     

    Shkurat T.P. Prevalence of miRNAs in Introns and Cis-Regulatory Regions of Genes of the Somatotropic Axis in Mammals / Shkurat T.P., Romanov D.E., Pshenichnyij E.A., Ponomareva N.S., Aleksandrova A.A., Bakhtadze G.B., Lomteva S.V. // American Journal of Applied Sciences . — 2015. — T. 1, № 12. — С. 1-7.

     

    Steinberg B. J. A package of fast tools for genomic sequence analysis / Steinberg B. J., Abu-Khalil J. M., Adigeyev M.G., Bout A. A., Kermanov A. V., Pshenichnyij E.A., Ramanchauskayte G.V., Kroshkina A. P., Gutnikov A.V., Ponomareva N.S., Panich A. E., Shkurat T.P. // International Journal of Mathematical Models and Methods in Applied Sciences ISSN: 1998-0140. — 2016. — T. 10 — С. 42-50.

     

    Shkurat T.P. Searching MiRNA Binding Sites in Metalloproteinase and Folate Cycle Genes / Shkurat T.P., Derevyanchuk E.G., Rebrova G.N., Neskubina O.M., Grigoryan N.A., Ponomareva N.S., Panich A.E. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 172.

     

    Shkurat T.P. Mir-17 MicroRNA Family in the Gonadotropins Regulation / Shkurat T.P., Ponomareva N.S., Lyangasova O.V., Battalov D.V., Panich A.E. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 167.

     

     Шкурат Т. П., Романов Д. Е., Пономарева Н. С., Бахтадзе Г. Б., Лянгасова О. В., Тимофеева С. В., Батталов Д. В., Панич А. Е., Капранов Ф., Распространенность микро РНК в интронах и окрестностях генов CGA, FSHB, LHB,  TSHB у млекопитающих с формированием различного числа доминирующих фолликулов // «Живые и биокосные системы». – 2015. – № 14; URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-14/article-13; line-height:normal;background:white'> 

     

    Shkurat T.P., Romanov D.E., Ponomareva N.S., Bakhtadze G.B., Lyangasova O. V., Timofeeva S.V., Batalov D.V., Panich A.E., Kapranov F. Prevalence of micro RNA in the vicinity of genes and introns of CGA, FSHB, LHB, TSHB genes in mammals with the formation of different dominant follicles number // «The Living and bio-inert system». – 2015. – № 14; URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-14/article-13

     

     

  • 2. Генетика репродукции

    Цель исследований - разработка новой технологии прогнозирования и ранней диагностики патологий беременности на основе панели геномных и постгеномных маркеров имплантации, синцитилизации, инвазии трофобласта и роста плода и создание научно-методического обеспечения для алгоритма оценки состояния плаценты и плода.

    Отобраны новые геномные и постгеномные маркеры, характеризующие генетическую предрасположенность к нарушению репродуктивных функций и разработана новая технология, позволяющая оценить основные этапы развития и состояние как плода, так и фетоплацентарного комплекса.

      

     Genetics of reproduction

     The aim of the research is to develop new technologies for forecasting and early diagnostics of pregnancy pathologies on the basis of panel of genomic and post-genomic markers of implantation, sensitization, invasion of the trophoblast and fetal growth and the creation of scientific and methodological support for the algorithm assessment of the placenta and fetus.

     New genomic and post-genomic markers for characterizing the genetic predisposition to reproductive functions impairment were selected and a new technology that allows to evaluate the main stages of the development and status of both the fetus and fetoplacental unit was developed.

     

     

      

  • Кандидат биологических наук е. в. машкина. 2004.
  • Публикации (Publications): 

    Shkurat T.P. The Intensity of Free Radical Processes and the Testosterone and Estradiol Levels in Seminal Fluid of Men with Different Types of Pathospermia - Personalized Approach [Электронный ресурс] / Shkurat T.P., Lomteva S.V., Sagamonova K.Yu., Shestel A., Prokofyev V.N., Sherchkova T.A., Shimanskaya E.V., Derevyanchuk E.G., Aleksandrova A.A. // Online J Health Allied Scs. — 2016. — № 1. URL: http://www.ojhas.org/issue57/2016-1-5.html

     

    Mashkina E.V. Association of gene polymorphisms of matrix metalloproteinases with reproductive losses in the first trimester of pregnancy / Mashkina E.V., Kovalenko K.A., Marakhovskaya T.A., Saraev K.N., Belanova A.A., Shkurat T.P. // Russian journal of genetics. — 2016. — T. 52, № 8. — С. 853-859.

     

    Shkurat T.P. VEGFA and TGF?1 Expression in Chorionic Tissue and Decidua of Women with Pregnancy Loss at the First Trimester / Shkurat T.P., Kovalenko K.A., Marakhovskaya T.A., Mashkina E.V. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 165.

     

  • 3. «Изучение вариабельности митохондриальной ДНК на основе анализа митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями»

    Цель исследований - выявление повреждений митохондриальной ДНК на основе анализа вариабельности митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями.

     

    Раскрытие этих связей даст новые знания об атерогенезе как возрастном дегенеративном патологическом процессе и создаст основу для разработки новых способов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. В данном исследовательском проекте будет изучена роль вариабельности митохондриальной ДНК (мтДНК) при ключевых сердечно-сосудистых заболеваниях и связанных с ними патологиях. Проект направлен на создание новых эффективных методов для скрининга, диагностики, контроля и лечения основных сердечно-сосудистых заболеваний и таким образом, предоставляет новые и более эффективные средства по борьбе с эпидемией сердечно-сосудистых заболеваний, сахарного диабета 2 типа и ожирением в России.

       

    The study of the mitochondrial DNA variability based on the analysis of the mitochondrial genome in atherosclerosis and associated with it diseases and conditions

     

    The purpose of the research is the identification of mitochondrial-DNA damage on the basis of the analysis of mitochondrial genome variability in atherosclerosis and associated with it diseases and conditions.

     Disclosure of these relationships will provide new knowledge about atherogenesis as age-related degenerative pathological process and create a framework for the development of new methods of genetic diagnosis, and genetic, biological and drug therapy. In this research project we will examine the role of variability of mitochondrial DNA (mtDNA) in the key cardiovascular diseases and associated pathologies. The project aims to create new effective methods for screening, diagnosis, monitoring and treatment of major cardiovascular diseases and thus provides a new and more effective tools to combat the epidemic of cardiovascular diseases, type 2 diabetes and obesity in Russia.

     

     Публикации (Publications):

    Sazonova M.A Mitochondrial Genome Sequencing in Atherosclerosis: What's Next? / Sazonova M.A, Shkurat T.P., Demakova N.A, Zhelankin A.V., Barinova V.A., Sobenin I.A., Orekhov A.N. // Current Pharmaceutical Design. — 2016. — T. 22, № 3. — С. 390-396.

     

    Shkurat T.P. MicroRNA Binding Sites in Mitochondrial Genes are Associated with the Progression of Atherosclerosis / Shkurat T.P., Timofeeva S.V., Demakova N., Romanov D.E., Butenko E.V. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 174.

    Galitsyna E.V. Mutations of mitochondrial DNA in chronic non-inflammatory diseases: target candidates for treatment [Электронный ресурс] / Galitsyna E.V., Sazonova M.A., Shkurat T.P., Demakova N.A., Melnichenko A.A., Sinyov V.V., Ryzhkova A.I., Mitrofanov K.Y., Zhelankin A.V., Sobenin I.A., Orekhov A.N. // Current Pharmaceutical Design. — 2016. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27774907

     

    Sazonova M. Creation of hybrid lines of monocyte origin with high heteroplasty level for mitochondrial genome mutation m.1555G>A [Электронныйресурс] / Sazonova M., Sinyov V., Ryzhkova A., Shkurat T.P., Demakova N, Nikitina N., Sobenin I., Orekhov A. // Atherosclerosis. — 2016. URL: http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(16)30797-3/abstract

     

    SazonovaV.A. Cybridmodelsofpathologicalcellprocessesindifferentdiseases [Электронный ресурс] / SazonovaV.A., SinyovV.V., RyzhkovaA.I., GalitsynaE.V., ShkuratT.P., MelnichenkoA.A., DemakovaN.A., PostnovA.Y., SobeninI.A., OrekhovA.N. // CurrentPharmaceuticalDesign. — 2016. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27855611

     

     

 

  • 4. Разработка ДНК-маркеров селекционно-ценных признаков для эффективного получения высокопродуктивных и устойчивых гетерозисных гибридов подсолнечника (руководитель профессор, д.б.н.,  Александр Вячеславович Усатов)

                 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5. Изучение механизмов резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам.  Поиск новых лекарств-стимуляторов (руководитель д.б.н., профессор Чистяков А.В.)

 

   

 

  

 

 

 

Вузы-партнеры:

      • Университет земли Саар.                                        
      • Ставропольский государственный университет.
      • Университет г. Авейру, Португалия.
      • Московский государственный университет.

 

Сотрудники кафедры принимали участие в выполнении следующих грантов:

      • ГНТП РАН Приоритетные направления генетики. Тема 
      • "Цитохром-450 лимфоцитов 
      • как тест система для оценки генотоксичности среды".
      • НТП ГК РФ по высшему образованию Тема: "Создание и апробация генетико-биохимической тест-системы мониторинга мутагенности окружающей среды с использованием листьев древесных растений".
      • НТП ГК РФ по высшему образованию в области фундаментальных проблем естествознания "Становление систем антиоксидантной защиты в онтогенезе Xenopus laevis".
      • НТП ГК РФ по высшему образованию в области фундаментальных проблем естествознания "Исследование роли внеядерных генетических детерминант подсолнечника в устойчивости растений к экстремальным воздействиям внешней среды".
      • «Разработка системы мониторинга здоровья школьников, студентов, преподавателей Ростовской области на основе молекулярно-генетических и биохимических маркеров»
      • «Развитие теории взаимодействия ядерных и цитоплазматических генетических компартментов в онтогенезе высших растений, как единой информационной системы, контролирующей рост, развитие и адаптационный потенциал»
      • «Разработка технологии мониторинга репродуктивной функции человека и развития плода с использованием новых геномных и постгеномных маркеров»
      • «Создание биоинформационной технологии поиска взаимосвязанных сценариев организации в геномах животных и человека некодирующей ДНК и кодирующей белок ДНК»

Студенты кафедры являются победителями: Всероссийского конкурса «Мой космос» (Баронян Е.С., 2007), Всероссийского конкурса «У.М.Н.И.К.» (Рыжков П. 2007 г., Деревянчук Е.Г. 2008 г.), Межвузовского конкурса красоты «Жемчужина Дона» (Заковоротняя Е.К., 2008 г.), а также принимают активное участие и регулярно одерживают победы в ежегодной студенческой «Неделе науки», являются обладателями Потанинской стипендии и стипендии им. Е.П. Гуськова.

 Места трудоустройства выпускников кафедры генетики:


Сеина Софья - РостНИПЧИ Роспотребнадзор, м.н.с.

Новикова Елена - НИИ Биологии, лаборатория промышленных микроорганизмов, м.н.с.

Миктадова Александра - НИИ Биологии ЮФУ, мнс

Наталья Нотченко - ООО "Ростовский зерновой терминал"

Виктория Тихобаева - аспирантура, кафедра генетики

Сидоренко Татьяна - аспирантура, кафедра физиологии

Шагайдина Татьяна - СЭС, г. Аксай, врач

Отзывы выпускников кафедры генетики:

Anzhelika Butenko, PhD candidate, Laboratory of Bioinformatics, Department of Biology and Ecology, Faculty of Sciences, University of Ostrava, Ostrava, Czech Republic.

В настоящее время я работаю научным сотрудником в лаборатории биоинформатики Университета г. Острава (Чехия) и здесь же обучаюсь в аспирантуре.

 Хотелось бы выразить огромную благодарность моему научному руководителю, Татьяне Павловне Шкурат, а также другим сотрудникам кафедры (особенно Елене Владимировне Машкиной, Анжеле Аслановне Александровой, Ивану Ивановичу Бессчетнову и Нине Ивановне Беличенко) за всегда внимательное отношение к студентам, а также выбор интересных и перспективных направлений исследований. Именно биоинформатика, которую стала развивать на кафедре генетики Татьяна Павловна, стала моим любимым делом и моей профессией. Часто вспоминаю междисциплинарные семинары по биоинформатике, проводимые кафедрой генетики совместно с кафедрой алгебры и дискретной математики, где можно было встретить новых интересных людей из совершенно других областей науки и заниматься поиском нетривиальных решений наших биологичеких проблем.

  

Константин Коваленко. Научный сотрудник лаборатории генетики человека и животных Академии биологии и биотехнологии ЮФУ.  

Ни разу не пожалел, что выбрал кафедру генетики. С удовольствием вспоминаю рассказы Е.П. Гуськова. Благодарен Т.П. Шкурат и Е.В. Машкиной, которые были моими научными руководителями, за огромную поддержку и понимание. Не менее благодарен всем остальным нашим преподавателям, которые создавали особую атмосферу кафедры генетики.

 

Прикрепленный файлРазмер
1.jpg19.95 кб
коллективное фото.jpg108.75 кб
беседа.jpg44.89 кб
доклад.jpg39.31 кб
диплома конференция.jpg12.48 кб
1.jpg135.41 кб
сортировка.jpg38 кб
подсолнухи.jpg94.47 кб
проростки.jpg59.39 кб
пробирки.jpg24.09 кб
петри.jpg17.26 кб
1.gif205.54 кб
Chistyakov.JPG101.62 кб
SAAR.jpg16.45 кб
1.jpg22.31 кб
1.jpg22.31 кб