КАФЕДРА ГЕНЕТИКИ
Контакты:
Адрес: 344090, г. Ростов-на-Дону, Стачки 194/1, ауд. 319
Телефон: +7(863) 219-87-94
E:mail: tshkurat@sfedu.ru
Сотрудники
Заведущая кафедры — Татьяна Павловная Шкурат, профессор, доктор биологических наук
Кафедра генетики и цитологии была основана в 1962 г. профессором И.Ф. Лященко. В 1982 г. в связи с реорганизацией кафедра была ликвидирована и вновь воссоздана в сентябре 1992 г. С 1972 по 2006 гг кафедрой заведовал выдающийся ученый, профессор, доктор биологических наук, академик Российской экологической академии, член корреспондент Гуманитарной Академии, Действительный член Национального географического общества Америки, Соросовский профессор — Евгений Петрович Гуськов. С 2006 г по настоящее время заведующим кафедрой является Татьяна Павловна Шкурат, профессор, доктор биологических наук, директор НИИ Биологии. Активное участие в работе кафедры принимают сотрудники НИИ Биологии.
Профессорско-преподавательский состав
- Татьяна Павловна Шкурат — зав. кафедрой, д.б.н., профессор.
- Александр Вячеславович Усатов — д.б.н., профессор.
- Светлана Сергеевна Амелина — д.б.н., профессор
- Нина Ивановна Беличенко — к.б.н, доцент.
- Иван Иванович Бессчетнов — к.б.н, доцент.
- Татьяна Викторовна Вардуни— д.п.н., профессор.
- Елена Владимировна Машкина — д.б.н., профессор.
- Анжела Аслановна Александрова — к.б.н., доцент.
- Мягкова Юлия Яковлевна — к.б.н., доцент.
- Николай Викторович Маркин — к.б.н., ст.преподаватель.
- Косенко Петр Олегович — к.б.н., ст.преподаватель.
- Чугуева Ольга Ивановна — к.б.н., ст.преподаватель.
- Елена Викторовна Бутенко — ассистент.
- Екатерина Григорьевна Деревянчук — ассистент.
Учебная работа
В состав преподаваемых на кафедре учебных дисциплин входят следующие:
- Биология клетки.
- Гистология.
- Биология индивидуального развития.
- Генетика с основами селекции.
- Теория эволюции.
- Проблемы современного естествознания.
- Философские проблемы естествознания.
- Э/к Генетика человека
- Современные проблемы генетики
- Экологическая генетика
- Биология старения,
- Отечественное естествознание в мировой науке
- Цитогенетика
- Гены и геномы
- Мутагены окружающей среды
- Генетика человека
- Генная инженерия
- Нехромосомная наследственность
- Медицинская генетика
- Молекулярная генетика
- Генетика растений
- История генетики
- Современные проблемы мутагенеза
- Геномика
- Компьютерные методы анализа генетических данных
- Молекулярно-генетические методы исследования
- Спортивная генетика
- Генетика старения.
Базы практики: Медико-генетический научный центр РАМН (Москва), ГНЦ РФ Институт медико-биологических проблем РАН (Москва), ГЦ «Биоинженерия» РАН (Москва), Институт физиологии растений РАН (Москва), НИИ Акушерства и Педиатрии (Ростов-на-Дону), АзНИРХ (Ростов-на-Дону), НИИ Биологии ЮФУ.
Сотрудники и студенты кафедры принимают активное участие в работе всероссийских и международных конференций, посвященных современным проблемам генетики.
Научная работа
Научно-исследовательская работа кафедры ведётся по направлениям:
1. Некодирующая ДНК
Цель исследований – разработка биоинформационной технологии поиска сценариев взаимодействия кодирующих белок и некодирующих белок участков ДНК, на основе теоретических расчетов большого объема данных с применением суперкомпьютеров, разработкой новых алгоритмов, программных приложений, построением математических моделей на основе особенностей организации геномов животных и человека.
Рассмотрены задачи, связанные с выявлением закономерностей во взаимном расположении взаимосвязанных участков одного генома (сравнительное картирование локусов, поиск гомологичных участков), а также со сравнением геномов разных видов (вычисление медиан геномов и построение филогенетического дерева), с целью обнаружения связи между генетическими и фенотипическими признаками, изучения гибкости различных программ автоматического сравнения.
Non-coding DNA
The aim of the research is the bioinformatics technology development for the interaction scenarios search of the encoding protein and non-coding protein DNA regions, on the basis of theoretical calculations of a large data amount with use of supercomputers, of new algorithms development, of the software applications and of the mathematical models construction based on characteristics of the animals and humans genomes organization.
The tasks associated with identifying regularities in the mutual arrangement of interrelated areas of one genome (comparative mapping of loci, the search for homologous sites) were considered as well as a comparison of the genomes of different species (calculation of median genomes and a phylogenetic tree construction), in order to detect connections between genetic and phenotypic characteristics and to study the different programs adaptability for the automatic comparison.
Публикации (Publications):
- Shkurat T.P. Prevalence of miRNAs in Introns and Cis-Regulatory Regions of Genes of the Somatotropic Axis in Mammals / Shkurat T.P., Romanov D.E., Pshenichnyij E.A., Ponomareva N.S., Aleksandrova A.A., Bakhtadze G.B., Lomteva S.V. // American Journal of Applied Sciences . — 2015. — T. 1, № 12. — С. 1-7.
- Steinberg B. J. A package of fast tools for genomic sequence analysis / Steinberg B. J., Abu-Khalil J. M., Adigeyev M.G., Bout A. A., Kermanov A. V., Pshenichnyij E.A., Ramanchauskayte G.V., Kroshkina A. P., Gutnikov A.V., Ponomareva N.S., Panich A. E., Shkurat T.P. // International Journal of Mathematical Models and Methods in Applied Sciences ISSN: 1998-0140. — 2016. — T. 10 — С. 42-50.
- Shkurat T.P. Searching MiRNA Binding Sites in Metalloproteinase and Folate Cycle Genes / Shkurat T.P., Derevyanchuk E.G., Rebrova G.N., Neskubina O.M., Grigoryan N.A., Ponomareva N.S., Panich A.E. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 172.
- Shkurat T.P. Mir-17 MicroRNA Family in the Gonadotropins Regulation / Shkurat T.P., Ponomareva N.S., Lyangasova O.V., Battalov D.V., Panich A.E. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 167.
- Шкурат Т. П., Романов Д. Е., Пономарева Н. С., Бахтадзе Г. Б., Лянгасова О. В., Тимофеева С. В., Батталов Д. В., Панич А. Е., Капранов Ф., Распространенность микро РНК в интронах и окрестностях генов CGA, FSHB, LHB, TSHB у млекопитающих с формированием различного числа доминирующих фолликулов // «Живые и биокосные системы». – 2015. – № 14; URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-14/article-13; line-height:normal;background:white’>
- Shkurat T.P., Romanov D.E., Ponomareva N.S., Bakhtadze G.B., Lyangasova O. V., Timofeeva S.V., Batalov D.V., Panich A.E., Kapranov F. Prevalence of micro RNA in the vicinity of genes and introns of CGA, FSHB, LHB, TSHB genes in mammals with the formation of different dominant follicles number // «The Living and bio-inert system». – 2015. – № 14; URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-14/article-13
2. Генетика репродукции
Цель исследований — разработка новой технологии прогнозирования и ранней диагностики патологий беременности на основе панели геномных и постгеномных маркеров имплантации, синцитилизации, инвазии трофобласта и роста плода и создание научно-методического обеспечения для алгоритма оценки состояния плаценты и плода.
Отобраны новые геномные и постгеномные маркеры, характеризующие генетическую предрасположенность к нарушению репродуктивных функций и разработана новая технология, позволяющая оценить основные этапы развития и состояние как плода, так и фетоплацентарного комплекса.
Genetics of reproduction
The aim of the research is to develop new technologies for forecasting and early diagnostics of pregnancy pathologies on the basis of panel of genomic and post-genomic markers of implantation, sensitization, invasion of the trophoblast and fetal growth and the creation of scientific and methodological support for the algorithm assessment of the placenta and fetus.
New genomic and post-genomic markers for characterizing the genetic predisposition to reproductive functions impairment were selected and a new technology that allows to evaluate the main stages of the development and status of both the fetus and fetoplacental unit was developed.
Публикации (Publications):
- Shkurat T.P. The Intensity of Free Radical Processes and the Testosterone and Estradiol Levels in Seminal Fluid of Men with Different Types of Pathospermia — Personalized Approach [Электронный ресурс] / Shkurat T.P., Lomteva S.V., Sagamonova K.Yu., Shestel A., Prokofyev V.N., Sherchkova T.A., Shimanskaya E.V., Derevyanchuk E.G., Aleksandrova A.A. // Online J Health Allied Scs. — 2016. — № 1. URL: http://www.ojhas.org/issue57/2016-1-5.html
- Mashkina E.V. Association of gene polymorphisms of matrix metalloproteinases with reproductive losses in the first trimester of pregnancy / Mashkina E.V., Kovalenko K.A., Marakhovskaya T.A., Saraev K.N., Belanova A.A., Shkurat T.P. // Russian journal of genetics. — 2016. — T. 52, № 8. — С. 853-859.
- Shkurat T.P. VEGFA and TGF?1 Expression in Chorionic Tissue and Decidua of Women with Pregnancy Loss at the First Trimester / Shkurat T.P., Kovalenko K.A., Marakhovskaya T.A., Mashkina E.V. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 165.
3. «Изучение вариабельности митохондриальной ДНК на основе анализа митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями»
Цель исследований — выявление повреждений митохондриальной ДНК на основе анализа вариабельности митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями.Раскрытие этих связей даст новые знания об атерогенезе как возрастном дегенеративном патологическом процессе и создаст основу для разработки новых способов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. В данном исследовательском проекте будет изучена роль вариабельности митохондриальной ДНК (мтДНК) при ключевых сердечно-сосудистых заболеваниях и связанных с ними патологиях. Проект направлен на создание новых эффективных методов для скрининга, диагностики, контроля и лечения основных сердечно-сосудистых заболеваний и таким образом, предоставляет новые и более эффективные средства по борьбе с эпидемией сердечно-сосудистых заболеваний, сахарного диабета 2 типа и ожирением в России.
The purpose of the research is the identification of mitochondrial-DNA damage on the basis of the analysis of mitochondrial genome variability in atherosclerosis and associated with it diseases and conditions.
Disclosure of these relationships will provide new knowledge about atherogenesis as age-related degenerative pathological process and create a framework for the development of new methods of genetic diagnosis, and genetic, biological and drug therapy. In this research project we will examine the role of variability of mitochondrial DNA (mtDNA) in the key cardiovascular diseases and associated pathologies. The project aims to create new effective methods for screening, diagnosis, monitoring and treatment of major cardiovascular diseases and thus provides a new and more effective tools to combat the epidemic of cardiovascular diseases, type 2 diabetes and obesity in Russia.
The study of the mitochondrial DNA variability based on the analysis of the mitochondrial genome in atherosclerosis and associated with it diseases and conditions.
Публикации (Publications):
- Sazonova M.A Mitochondrial Genome Sequencing in Atherosclerosis: What’s Next? / Sazonova M.A, Shkurat T.P., Demakova N.A, Zhelankin A.V., Barinova V.A., Sobenin I.A., Orekhov A.N. // Current Pharmaceutical Design. — 2016. — T. 22, № 3. — С. 390-396.
- Shkurat T.P. MicroRNA Binding Sites in Mitochondrial Genes are Associated with the Progression of Atherosclerosis / Shkurat T.P., Timofeeva S.V., Demakova N., Romanov D.E., Butenko E.V. // Annals Academy of Medicine Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 174.
- Galitsyna E.V. Mutations of mitochondrial DNA in chronic non-inflammatory diseases: target candidates for treatment [Электронный ресурс] / Galitsyna E.V., Sazonova M.A., Shkurat T.P., Demakova N.A., Melnichenko A.A., Sinyov V.V., Ryzhkova A.I., Mitrofanov K.Y., Zhelankin A.V., Sobenin I.A., Orekhov A.N. // Current Pharmaceutical Design. — 2016. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27774907
- Sazonova M. Creation of hybrid lines of monocyte origin with high heteroplasty level for mitochondrial genome mutation m.1555G>A [Электронныйресурс] / Sazonova M., Sinyov V., Ryzhkova A., Shkurat T.P., Demakova N, Nikitina N., Sobenin I., Orekhov A. // Atherosclerosis. — 2016. URL: http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(16)30797-3/abstract
- SazonovaV.A. Cybridmodelsofpathologicalcellprocessesindifferentdiseases [Электронный ресурс] SazonovaV.A., SinyovV.V., RyzhkovaA.I., GalitsynaE.V., ShkuratT.P., MelnichenkoA.A., DemakovaN.A., PostnovA.Y., SobeninI.A., OrekhovA.N. // CurrentPharmaceuticalDesign. — 2016. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27855611
4. Разработка ДНК-маркеров селекционно-ценных признаков для эффективного получения высокопродуктивных и устойчивых гетерозисных гибридов подсолнечника (руководитель профессор, д.б.н., Александр Вячеславович Усатов).
5. Изучение механизмов резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Поиск новых лекарств-стимуляторов (руководитель д.б.н., профессор Чистяков А.В.)